黏液状微生物或许是保持珊瑚礁健康的关键秘密

Coral reefs, such as Los Jardines de la Reina, pictured, have microbes that may help protect the coral against certain nutrient imbalances.
The slimy microbes can take up and “scrub out” nitrogen from a coral’s surroundings.Image: Robert Walker
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  • 麻省理工学院(MIT)与伍兹霍尔海洋研究所(WHOI)的研究人员发现了一些微生物,它们可能有助于保护珊瑚免受某些营养失衡的影响。

  • 这些微生物具有黏液状生物膜,能够从珊瑚周围环境中吸收并“清除”氮。

  • 通过吸收过量的氮,这些微生物可能会阻止藻类竞争,从而保护其所栖居的珊瑚。

珊瑚经过数千年的进化,能够在营养物质稀少的水域中生存,甚至生长繁茂。在健康的珊瑚礁中,海水通常极为清澈,主要是因为珊瑚已找到充分利用周围少量资源的方法。这些条件的任何变化都可能打破珊瑚健康的平衡。

如今,麻省理工学院(MIT)与伍兹霍尔海洋研究所(WHOI)的研究人员与古巴的海洋学家和海洋生物学家合作,发现了一些珊瑚物种黏液状生物膜中栖居的微生物,它们可能有助于保护珊瑚免受某些营养失衡的影响。

研究团队发现,这些微生物能够从珊瑚周围环境中吸收并“清除”氮。在低浓度下,氮可以是珊瑚的必需营养素,为其生长提供能量。但氮过量(例如来自富含氮的肥料渗入海洋)可能引发藻类大量繁殖。藻类可能与珊瑚争夺资源,使珊瑚礁承受压力并失去色彩而白化。

通过吸收过量的氮,这些新发现的微生物可能会阻止藻类竞争,从而充当其所栖居珊瑚的微小保护者。全球各地的珊瑚正因全球变暖而广泛承受压力并出现白化,但似乎有些物种已找到方法,保护自己免受其他与氮相关的压力来源的影响。

“在与珊瑚共生的这些生物中,有一个值得注意的方面:珊瑚能够以一种天然方式应对人为影响,至少在氮的可用性方面是如此,这是一件非常好的事情,”麻省理工学院地球、大气与行星科学系多尔蒂海洋资源利用助理教授安德鲁·巴宾(Andrew Babbin)说道。“这可能是珊瑚礁能够保护自己的一种非常天然的方式,至少在一定程度上是如此。”

巴宾及其同事,包括麻省理工学院的研究生迪安娜·杜米特(Diana Dumit)、泰勒·塔马西(Tyler Tamasi)、劳拉·韦伯(Laura Weber)和萨拉·施瓦茨(Sarah Schwartz),已发表了他们的研究发现,刊登于《ISME期刊》。

类死区模拟

巴宾的团队研究海洋中的生物群落如何循环氮,氮是生命的关键元素。海洋中的氮可以多种形式存在,例如氨、亚硝酸盐和硝酸盐。巴宾尤其关注氮在缺氧环境中如何循环或被吸收——这些低氧区域也被称为“死区”,那里鲜有鱼类,但微生物生命却能繁盛。

这些微生物可能有助于保护珊瑚免受某些营养失衡的影响。Image: 《自然·通讯》

“缺氧到无法维持鱼类生存的地方,正是细菌开始发生不同变化的地方,这对我们来说非常令人兴奋,”巴宾说。“例如,它们可能开始消耗硝酸盐,这进而会影响水体特定区域的生产力。”

死区并非海洋中细菌表现出食氮行为的唯一缺氧区域。在较小尺度上也可以发现低氧环境,例如生物膜内部——生物膜是一层富含微生物的黏液,覆盖着从沉船船体到珊瑚礁等各种海洋表面。

“我们体内也有生物膜,使不同的厌氧过程得以发生,”巴宾指出。“珊瑚也是如此,它们能够分泌大量黏液,这些黏液起到了阻挡氧气的屏障作用。”

尽管珊瑚靠近水面,并且能够接触到氧气,巴宾仍想知道珊瑚黏液是否会促进“缺氧微区”的形成,即氧气浓度较低且集中的区域,而消耗硝酸盐的细菌可能在那里繁盛。

他向伍兹霍尔海洋研究所的海洋微生物学家艾米·阿普里尔(Amy Apprill)提出了这一想法。2017年,研究人员随一支科研团队启程前往古巴,阿普里尔曾计划在受保护的国家公园“皇后花园”(Jardines de la Reina,意为“王后花园”)开展珊瑚研究。

“这一受保护区域是加勒比地区健康珊瑚的最后避难所之一,”巴宾说。“我们希望研究这些受影响较小的区域之一,以获得与珊瑚本身相关的氮循环动态的基线数据,这将使我们能够了解人为扰动会对该系统产生何种影响。”

采集样本以寻找清除者

在考察珊瑚礁的过程中,科学家们从该地区数量较多的珊瑚物种中采集了少量样本。在船上,他们将每个珊瑚样本置于其自身的海水中培养,并加入一种氮示踪剂——这是一种比海水中天然存在的分子略微偏重的版本。

他们将样本带回剑桥,并使用质谱仪进行分析,以测量氮分子的平衡随时间的变化情况。根据样本中被消耗或产生的分子类型,研究人员可以估算氮被还原并实际发生反硝化的速率,或通过其他代谢过程增加的速率。

在几乎每个珊瑚样本中,他们观察到反硝化速率高于大多数其他过程;这表明珊瑚本身可能存在某种吸收该分子的物质。

研究人员擦拭了每个珊瑚的表面,并将黏液状样本在培养皿中培养,随后检测其中已知能够代谢氮的特定细菌。该分析揭示了多种能够清除氮的细菌,它们存在于大多数珊瑚样本中。

“我们的结果表明,这些与珊瑚共生的生物具有清理局部环境的能力,”巴宾说。“有些珊瑚物种,例如这种脑珊瑚Diploria,其氮循环速度极快,而且即便在人为变化的影响下也相当耐受,而Acropora在整个加勒比地区状况堪忧,其氮循环活动却非常微弱。”

氮清除微生物是否直接促进珊瑚的健康,目前仍不明确。该团队的研究结果是此类关联的首个证据。展望未来,巴宾计划探索海洋的其他区域,例如热带太平洋,以确定其他珊瑚上是否存在类似微生物,以及这些细菌在多大程度上有助于保护其宿主。他推测,它们的作用与我们自身系统中的微生物相似。

“我们越是研究人类微生物组,就越意识到与我们共生的生物确实影响着我们的健康,”巴宾说。“珊瑚礁也完全如此。正是珊瑚微生物组决定了珊瑚系统的健康状况。而我们正在努力揭示,珊瑚系统内的这一微生物网络中究竟包含哪些代谢过程。”

本研究部分得到了麻省理工学院海洋资助计划(MIT Sea Grant)、西蒙斯基金会(Simons Foundation)、麻省理工学院的Montrym、Ferry和mTerra基金,以及Bruce Heflinger(1969年本科、1971年硕士、1980年博士)的资助。

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