新冠变异株:现有快速抗原检测能否检测出新毒株?

A rapid COVID-19 test on top of a pile of face masks.
Most rapid antigen tests for COVID-19 detect the nucleocapsid protein.Image: Unsplash/Guido Hofmann
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  • 每当一种新的新冠变异株出现,人们就会提出疑问:现有诊断检测是否仍然有效?

  • 一项新研究显示,变异株出现可使其逃避诊断检测的核衣壳蛋白(N蛋白)突变的情况相对少见。

  • 不过,仍有少数序列可能影响检测。

  • 准确、高效地识别感染者,仍是遏制新冠疫情至关重要的策略。

快速抗原检测的普及大大推动了遏制新冠传播的工作。但每一种新的需关注变异株出现,都会引发人们对诊断检测是否仍然有效的疑问。

这项发表于《Cell》的新研究试图回答这些问题。

研究人员开发了一种新方法,用于评估突变如何影响快速抗原检测所用抗体对SARS-CoV-2的识别。

由于大多数快速抗原检测针对SARS-CoV-2核衣壳蛋白(N蛋白),研究团队直接测量了N蛋白突变如何影响诊断抗体识别其靶标的能力。

“根据我们的研究结果,过去和目前主要的SARS-CoV-2需关注变异株中,没有任何一种含有会影响现有快速抗原检测识别抗体能力的突变,”论文第一作者、埃默里大学生物化学系助理教授菲利普·弗兰克(Filipp Frank)说。“此外,这些数据使我们能够提前一步,预测检测对几乎任何可能出现的变异株的表现。”

这项研究采用了一种名为深度突变扫描的方法,在一次高通量实验中评估N蛋白所有可能的突变。随后,研究人员测量了这些突变对其与11种市售快速抗原检测所用抗体相互作用的影响,并确定了可能使病毒逃避抗体识别的突变。

“准确、高效地识别感染者,仍是遏制新冠疫情至关重要的策略;我们的研究提供了有关未来SARS-CoV-2突变的信息,这些突变可能干扰检测,”该研究资深作者、生物化学系教授埃里克·奥特伦德(Eric Ortlund)说。“本文所述结果能帮助我们迅速适应病毒变化,随着新变异株不断出现,这将立即对临床和公共卫生产生影响。”

研究结果显示,变异株出现可使其逃避诊断检测的N蛋白突变的情况相对少见,但仍有少数序列可能影响检测。研究人员、公共卫生官员和检测制造商可以利用这些数据,判断是否需要评估某项诊断检测识别这些突变的能力,或为未来检测的设计提供依据。

“考虑到新变异株的不断涌现,这项研究的数据在未来多年都将发挥作用,”美国国立生物医学成像与生物工程研究所(NIBIB)所长、美国国立卫生研究院(NIH)快速加速诊断技术计划(RADx Tech)负责人布鲁斯·J·特龙伯格(Bruce J. Tromberg)说。

研究作者指出,尽管许多需关注变异株的N蛋白含有多个突变,但他们的方法并未评估多个突变如何影响诊断抗体的识别能力,这是该研究的一项局限。

该项目获得了NIBIB通过RADx计划提供的支持。

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