我们身边无处不有微生物,而且它们的数量远超我们。据最新估算,每个人类细胞对应十个微生物。我们每个人体内携带约100万亿个微生物,以及它们的500万个基因;这些微生物的总重量相当于每人五磅。
科学家显然会影响周遭的一切, 但我们对微生物的认识还处于起步阶段。大肠杆菌就是一个例子:它很容易在实验室中培养——99%的微生物都无法做到这一点。大肠杆菌近100年前就已被发现,但我们至今仍不知道它三分之一的基因有什么作用。
科学家表示,更深入、全面地了解微生物,有助于实现重要的健康进展,例如更高效地追踪疾病暴发,或阻止抗生素耐药性葡萄球菌在医院传播。两项正在发展的技术有助于我们了解这些最微小的邻居:基因测序和大数据。前者是绘制我们周围微生物组图谱的关键;后者则用于处理、分析并分类绘图本身产生的所有信息。
绘制复杂而详尽的图谱可能需要数十年,但基因测序已取得长足进展。1995年,测序首个细菌基因组耗时13个月。如今只需几天。同样,基因测序的成本在过去13年里 大幅下降。离子半导体测序和单分子实时测序等新兴技术,能够更快地生成更长DNA序列的更多细节,或可进一步拓展这一领域的前沿。
然而,更快、更便宜的测序会产生更多数据,因此大数据成为微生物组研究不可或缺的一部分。例如,一项近期开展、为期18个月的纽约市地铁微生物组研究生成了105亿个化学片段,检测出超过15,000种生命形式,从泡菜到脑膜炎菌都有。若没有大数据解决方案,就不可能处理如此大量的信息。
从微生物组角度观察环境,也可能带来新的公共卫生方法。例如,在芝加哥,专家正每天收集数据,追踪一家新医院在第一年里逐渐形成的微生物组。最终目标是进一步了解哪些微生物会消亡、哪些会重新出现、哪些仍保持活跃……然后尝试据此调整环境。
当然,终极目标是实现对微生物组全面动态、实时的测绘。哈佛或许走在前列,利用大数据处理来自数千个传感器的信息;这些传感器每天追踪哈佛森林这片1,500公顷林地的土壤、水乃至风的变化。目标是创建基于数据的算法,最终关联并预测森林生态系统中彼此相连的部分。随着时间推移,这类信息或有助于管理森林发展或控制入侵物种。
绘制微生物组图谱或许并非易事,但看来,我们对这些微小单细胞生物的认识,可能会深刻塑造未来。
本文由 GE Look Ahead合作发布。本文的发布并不意味着世界经济论坛认可其中观点。
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作者:Holly Hickman 为 GE Look Ahead 撰稿。
图片:在INSERM的Biotis实验室,一名研究人员在对人体细胞进行激光生物3D打印后使用显微镜。路透社/Regis Duvignau

